Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUJ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUJ7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WUJ7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms