Protein–RNA interactions for Protein: U3KPZ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KPZ7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KPZ7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KPZ7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KPZ7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KPZ7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KPZ7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KPZ7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KPZ7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KPZ7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KPZ7 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KPZ7 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KPZ7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KPZ7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KPZ7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KPZ7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KPZ7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KPZ7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KPZ7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KPZ7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KPZ7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KPZ7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KPZ7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KPZ7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KPZ7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KPZ7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KPZ7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 SPATA45-201ENST00000332912 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KPZ7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
U3KPZ7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
U3KPZ7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
U3KPZ7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
U3KPZ7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
U3KPZ7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
U3KPZ7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
U3KPZ7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
U3KPZ7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
U3KPZ7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 AC010487.2-201ENST00000594546 486 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KPZ7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms