Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms