Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGSF9BQ9UPX0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms