Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms