Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms