Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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