Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms