Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGSF9Q9P2J2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGSF9Q9P2J2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGSF9Q9P2J2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGSF9Q9P2J2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGSF9Q9P2J2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGSF9Q9P2J2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGSF9Q9P2J2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGSF9Q9P2J2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IGSF9Q9P2J2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGSF9Q9P2J2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGSF9Q9P2J2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGSF9Q9P2J2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms