Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms