Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms