Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms