Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms