Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms