Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEBOXQ9HB31 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms