Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms