Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms