Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms