Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms