Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms