Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms