Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms