Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms