Protein–RNA interactions for Protein: Q96S99

PLEKHF1, Pleckstrin homology domain-containing family F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1Q96S99 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF1Q96S99 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLEKHF1Q96S99 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLEKHF1Q96S99 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLEKHF1Q96S99 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLEKHF1Q96S99 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PLEKHF1Q96S99 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLEKHF1Q96S99 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLEKHF1Q96S99 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLEKHF1Q96S99 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLEKHF1Q96S99 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLEKHF1Q96S99 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLEKHF1Q96S99 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLEKHF1Q96S99 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLEKHF1Q96S99 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLEKHF1Q96S99 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PLEKHF1Q96S99 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLEKHF1Q96S99 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PLEKHF1Q96S99 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLEKHF1Q96S99 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLEKHF1Q96S99 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLEKHF1Q96S99 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PLEKHF1Q96S99 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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