Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms