Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms