Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms