Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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RNF185Q96GF1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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RNF185Q96GF1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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RNF185Q96GF1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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