Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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