Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms