Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms