Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPC24Q8NBT2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPC24Q8NBT2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPC24Q8NBT2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SPC24Q8NBT2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPC24Q8NBT2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPC24Q8NBT2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPC24Q8NBT2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPC24Q8NBT2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPC24Q8NBT2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPC24Q8NBT2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPC24Q8NBT2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPC24Q8NBT2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPC24Q8NBT2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPC24Q8NBT2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPC24Q8NBT2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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