Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PROM2Q8N271 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROM2Q8N271 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms