Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms