Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms