Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms