Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms