Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
STRCQ7RTU9 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms