Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms