Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms