Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms