Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms