Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FHOD3Q2V2M9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms