Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FXNQ16595 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FXNQ16595 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FXNQ16595 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FXNQ16595 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FXNQ16595 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FXNQ16595 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FXNQ16595 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FXNQ16595 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FXNQ16595 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FXNQ16595 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FXNQ16595 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FXNQ16595 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FXNQ16595 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FXNQ16595 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FXNQ16595 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FXNQ16595 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FXNQ16595 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FXNQ16595 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FXNQ16595 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FXNQ16595 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FXNQ16595 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FXNQ16595 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FXNQ16595 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FXNQ16595 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FXNQ16595 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FXNQ16595 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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FXNQ16595 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FXNQ16595 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FXNQ16595 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FXNQ16595 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FXNQ16595 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FXNQ16595 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FXNQ16595 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FXNQ16595 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FXNQ16595 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FXNQ16595 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FXNQ16595 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FXNQ16595 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FXNQ16595 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FXNQ16595 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FXNQ16595 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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FXNQ16595 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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FXNQ16595 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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FXNQ16595 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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FXNQ16595 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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FXNQ16595 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FXNQ16595 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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FXNQ16595 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FXNQ16595 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FXNQ16595 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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FXNQ16595 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FXNQ16595 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FXNQ16595 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FXNQ16595 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FXNQ16595 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FXNQ16595 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FXNQ16595 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FXNQ16595 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FXNQ16595 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FXNQ16595 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FXNQ16595 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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