Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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