Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF2Q15853 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
USF2Q15853 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
USF2Q15853 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
USF2Q15853 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms