Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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SEC23BQ15437 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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SEC23BQ15437 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SEC23BQ15437 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SEC23BQ15437 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SEC23BQ15437 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SEC23BQ15437 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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