Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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