Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
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