Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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TRAM2Q15035 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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